鱼缸过滤材料分类方式是将滤材分为了物理滤材、化学滤材和生物滤材。物理滤材顾名思义，就是在其过滤过程中完全没有任何反应发生，仅通过物理原理来进行过滤。

物理滤材主要过滤掉的是水中肉眼可见的，通过水泵带来的杂质，如鱼类的排泄物、食物残渣等鱼类的生活垃圾。物理滤材在任何形式的过滤系统中都会被采用，并且通常用在过滤最开始的第一步。常见的物理滤材有白棉、羊绒棉等，其价格在每平米几元到几十元不等，是最常见也是使用最广泛的滤材。

化学滤材一般在水族箱中经常使用，但并不算常见，往往根据实际情况来选择性的使用，由此可见化学滤材并非鱼缸过滤的必须品。常用的化学过滤器有活性炭和阳离子交换树脂。活性炭具有较强的吸附作用，通常用于去除下药治疗结束后水体中残留的药物。活性炭可以吸附重金属离子，但需要定期更换，否则一旦活性炭吸附功能达到饱和，将反向释放有害物质污染水体。

阳离子交换树脂可以分为氢型阳离子交换树脂和钠型阳离子交换树脂两种，主要用于降低水的硬度，氢型阳离子交换树脂同时可以调节水质的pH值。钠型阳离子交换树脂可以通过置换水中的钙镁离子来降低水的硬度，经过一段时间的使用后还可以使用盐还原，再利用。一般化学滤材用在物理滤材之后。

生物滤材的主要作用是为硝化细菌提供一个寄宿的载体，常见的生物滤材有陶瓷球、陶瓷环、细菌屋、石英球、导菌砖、藤棉、生物棉以及各类砂石等。

硝化细菌将水中有害的氨最终转化为硝酸盐，从而保障的鱼儿的生存环境，可以说是过滤系统中最重要的一部分，通常作为水体处理的最后一步，用在化学滤材之后。生物滤材的价格高低不一，目前盛行的导菌砖的市场价从每箱几百到几千不等。